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diff --git a/pdf/doc.tex b/pdf/doc.tex index 529b087..49875b5 100644 --- a/pdf/doc.tex +++ b/pdf/doc.tex @@ -156,7 +156,7 @@ Suite à ces travaux, un certain nombre de nouvelles publications vont apporter avec par exemple l'encodage de Goldman \cite{goldman2013towards} qui propose l'utilisation d'une base 3 (Figure \ref{fig:goldman-encoding}), plus performante en densité de stockage. -\begin{figure} +\begin{figure}[ht] \centering \includegraphics[width=.6\textwidth]{goldman-encoding} \caption{Encodage de Goldman \cite{goldman2013towards}} @@ -175,7 +175,7 @@ Premièrement, la molécule est plus stable sous cette forme, ce qui limite sa d Deuxièmement, il s'agit de la forme utilisée par l'ensemble des organismes vivants de notre planète\footnote{En considérant que les virus ne sont pas vivants}, ce qui nous permet donc potentiellement de profiter des mécanismes du vivant, tels que la réparation automatique de l’\ac{adn} pour corriger les erreurs -ou la division cellulaire qui va permettre une copie peu coûteuse et très rapide de grande quantité de données. +ou la division cellulaire qui va permettre une copie peu coûteuse et très rapide de grandes quantités de données. Cependant, faire en sorte qu'une molécule d'\ac{adn} soit compatible avec un être vivant lui ajoute des contraintes supplémentaires. En particulier, en plus de garantir un taux de GC équilibré, @@ -192,7 +192,7 @@ Il est donc intéressant d'en insérer un maximum pour limiter la casse dans l'à En ce qui concerne la lecture des données, on utilise un séquenceur génétique portatif à nanopore tels que celui utilisé par l’équipe de H. Yadzi \cite{yazdi2017portable} et présenté sur la Figure \ref{fig:oxford-nanopore-minion}. Les séquenceurs en général ont un problème avec la lecture des homopolymères, c’est-à -dire des -séquences de répétitions d’un même nucléotide. On interdit donc les séquences de plus de 3 fois +séquences de répétitions d’un même nucléotide. On interdit donc les séquences de plus de trois fois le même nucléotide pour éviter les erreurs de séquençage. \begin{figure}[ht] |