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authorn-peugnet <n.peugnet@free.fr>2021-10-29 11:56:30 +0200
committern-peugnet <n.peugnet@free.fr>2021-10-29 11:56:30 +0200
commitbe76fce30ce2d7a3273530ca69039c796f8b4ece (patch)
tree5d7cd69407118cca576388b88057edf5cfc6eb44 /pdf/doc.tex
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-rw-r--r--pdf/doc.tex6
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diff --git a/pdf/doc.tex b/pdf/doc.tex
index 529b087..49875b5 100644
--- a/pdf/doc.tex
+++ b/pdf/doc.tex
@@ -156,7 +156,7 @@ Suite à ces travaux, un certain nombre de nouvelles publications vont apporter
avec par exemple l'encodage de Goldman \cite{goldman2013towards} qui propose l'utilisation d'une base 3 (Figure \ref{fig:goldman-encoding}),
plus performante en densité de stockage.
-\begin{figure}
+\begin{figure}[ht]
\centering
\includegraphics[width=.6\textwidth]{goldman-encoding}
\caption{Encodage de Goldman \cite{goldman2013towards}}
@@ -175,7 +175,7 @@ Premièrement, la molécule est plus stable sous cette forme, ce qui limite sa d
Deuxièmement, il s'agit de la forme utilisée par l'ensemble des organismes vivants de notre planète\footnote{En considérant que les virus ne sont pas vivants},
ce qui nous permet donc potentiellement de profiter des mécanismes du vivant,
tels que la réparation automatique de l’\ac{adn} pour corriger les erreurs
-ou la division cellulaire qui va permettre une copie peu coûteuse et très rapide de grande quantité de données.
+ou la division cellulaire qui va permettre une copie peu coûteuse et très rapide de grandes quantités de données.
Cependant, faire en sorte qu'une molécule d'\ac{adn} soit compatible avec un être vivant lui ajoute des contraintes supplémentaires.
En particulier, en plus de garantir un taux de GC équilibré,
@@ -192,7 +192,7 @@ Il est donc intéressant d'en insérer un maximum pour limiter la casse dans l'Ã
En ce qui concerne la lecture des données, on utilise un séquenceur génétique portatif à
nanopore tels que celui utilisé par l’équipe de H. Yadzi \cite{yazdi2017portable} et présenté sur la Figure \ref{fig:oxford-nanopore-minion}.
Les séquenceurs en général ont un problème avec la lecture des homopolymères, c’est-à-dire des
-séquences de répétitions d’un même nucléotide. On interdit donc les séquences de plus de 3 fois
+séquences de répétitions d’un même nucléotide. On interdit donc les séquences de plus de trois fois
le même nucléotide pour éviter les erreurs de séquençage.
\begin{figure}[ht]